رافائل گروسی، در بیانیه‌ای که برای ارائه در در دومین نشست شورای امنیت سازمان ملل آماده شده بود، اعلام کرد که حملات اخیر اسرائیل به تأسیسات هسته‌ای ایران موجب تضعیف شدید ایمنی و امنیت هسته‌ای در این کشور شده است.بر اساس گزارش آژانس، در سایت نطنز، تأسیسات اصلی غنی‌سازی سوخت هدف حملات ۱۳ ژوئن (۲۳ خرداد) قرار گرفت و تأسیسات برق و ژنراتورهای پشتیبان آن نابود شدند. سالن اصلی سانتریفیوژها نیز با بمب‌های نفوذی به‌شدت آسیب دید. بخش دیگر این سایت، یعنی تأسیسات پایلوت غنی‌سازی سوخت، نیز به‌ویژه در قسمت‌های سطحی به‌طور کامل تخریب شده و قسمت‌های زیرزمینی آن خسارات جدی دیده‌اند.در سایت اصفهان، چهار ساختمان شامل آزمایشگاه مرکزی شیمی، کارخانه تبدیل اورانیوم، تأسیسات تولید سوخت راکتور تهران و تأسیسات پردازش فلز اورانیوم (که در حال ساخت بود) آسیب دیده‌اند.گروسی تأکید کرد که هرچند در خارج از این تأسیسات افزایش سطح تشعشعات گزارش نشده، اما در داخل برخی از این سایت‌ها، از جمله نطنز، آلودگی شیمیایی و رادیولوژیک وجود دارد که می‌تواند برای کارکنان خطرناک باشد.
به گفته گروسی، خطرناک‌ترین سناریو مربوط بهنیروگاه بوشهر است که حاوی هزاران کیلوگرم مواد هسته‌ای است و همچنان در حال بهره‌برداری است. به گفته او، حمله مستقیم به این تأسیسات یا قطع خطوط برق آن می‌تواند منجر به ذوب‌شدن قلب راکتور و رها شدن مقادیر بالای مواد رادیواکتیو شود.در تهران نیز، ساختمان‌هایی که محل ساخت و آزمایش سانتریفیوژهای پیشرفته بوده‌اند، مورد حمله قرار گرفته‌اند. در کارگاه کرج نیز دو ساختمان مربوط به تولید قطعات سانتریفیوژ نابود شده‌اند.
گروسی هشدار داد که هرگونه حمله به تأسیسات فعال هسته‌ای مانند بوشهر و راکتور تحقیقاتی تهران می‌تواند تبعات گسترده‌ای برای سلامت عمومی و محیط زیست داشته باشد و ممکن است اقدامات حفاظتی مانند تخلیه جمعیت یا مصرف ید پایدار را در پی داشته باشد.مدیرکل آژانس از همه طرف‌ها خواست حداکثر خویشتنداری را به خرج دهند. او تأکید کرد که آژانس باید هرچه سریع‌تر بازرسی از تأسیسات ایران را از سر بگیرد، به‌ویژه با توجه به اینکه بیش از ۴۰۰ کیلوگرم از ذخایر اورانیوم ایران دارای غنای ۶۰ درصد است.وی همچنین هشدار داد که هرگونه تلاش ایران برای حفاظت از مواد و تجهیزات هسته‌ای خود باید در چارچوب تعهدات پادمانی آن کشور انجام شود و بازرسان آژانس باید اجازه داشته باشند که صحت و سلامت این مواد را تأیید کنند.گروسی با اشاره به مسئولیت کشور میزبان در قبال امنیت بازرسان، از ایران خواست تا خطوط ارتباطی آژانس با بازرسان حفظ شود.او در پایان تصریح کرد که آژانس آمادگی دارد کارشناسان ایمنی و امنیت هسته‌ای خود را به ایران اعزام کند و نقش حیاتی خود را برای جلوگیری از بروز بحران ایفا کند. وی تأکید کرد که راه‌حل دیپلماتیک همچنان ممکن است و نباید این فرصت از دست برود.